Поперечный синус — парный, находится в поперечной борозде костей черепа, располагаясь вдоль заднего края намёта мозжечка. На уровне внутреннего затылочного выступа поперечные синусы сообщаются между собой.

Поперечный синус, залегает в месте отхождения от твердой оболочки головного мозга намета мозжечка с внутренней стороны затылочной кости, находится на одной линии с верхней выйной линией, служащей местом прикрепления трапециевидной мышцы. Выйная связка, таким образом, является наружным продолжением серпа, а фасция трапециевидной мышцы является продолжением намета мозжечка.

На уровне внутреннего затылочного выступа поперечные синусы сообщаются между собой. В области сосцевидных углов теменных костей поперечные синусы переходят в сигмовидные синусы, каждый из которых открывается через яремное отверстие в луковицу яремной вены.